Google携手Microsoft布局生物医学市场，AI推动创新性变革：Google携手Microsoft布局

原标题：Google携手Microsoft布局生物医学市场， AI推动创新性变革

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近期， BroadInstitute、Verily宣布与Microsoft成为战略合作伙伴，加速推动Terra平台迅速朝向生物医学方面发展，让癌症基因体学、单细胞转录学、传染性疾病、医疗与族群遗传等四大领域研究得以有突破式创新。
当前Microsoft正筹划将全球16.8万医疗保健用户作为扩展Terra首要客群，透过GoogleCloud与Azure多云模式部署，赋予Terra优异的AI、储存与云端运算能力，让用户可处理大量且复杂之数据并获取预测性信息。
在科学界有一种说法：所有生物学都是计算生物学。
换句话说，当您处理整个基因组，或处理包含成千上万个生物标记的成千上万条记录汇编的数据集时，您需要强大的计算能力和技术来充分利用数据。现在，为生物医学研究而构建的云平台正在提供这些项目所需的功能。
三年前，谷歌母公司Alphabet的生命科学部门Verily ，与麻省理工学院和哈佛大学的生物医学与基因组研究中心BroadInstitute ，共同建立了Terra ，这是一个用于存储和分析生物医学数据的开源云研究平台。
BroadInstitute首席数据官AnthonyPhilippakis说，该平台的创建是由更广阔的生物医学领域的两个趋势推动的：可用数据的数量和类型激增——从基因组数据到医学成像和电子健康记录——以及生物医学领域对数据共享的更大需求。
他说：“没有一个组织，无论是医疗中心，大学还是公司，都拥有足够的数据来处理诸如疾病的遗传基础之类的深刻问题。 ”
“很长一段时间以来，尽管我们已经接受了数据共享的想法，特别是在基因组学以及其他许多领域，我们的运作方式却有些愚蠢，也就是说，为了共享数据，我们必须将其复制：将副本存储在服务器上，并告诉研究人员将其下载到本地环境中。 ”他解释说。
这极具挑战性，因为它们非常昂贵，最终会在每个研究机构存储每个数据集的副本，而且也很不安全，因为当开始下载数据时，很难跟踪和审核谁接触过数据，并且出于什么目的。
Terra开源平台旨在解决这个问题，现在有超过15,500个用户。
其中包括帕金森病加速药物合作伙伴关系（正在研究新的生物标记物，以帮助诊断疾病，开发新的治疗方法或帮助改善预后），以及美国国立卫生研究院的“所有人”项目。 Verily自己的ProjectBaseline是Terra的另一个用户，该基线始于2017年，用于随着时间的推移跟踪人体健康。
Terra包含来自将近200万研究参与者的许多公开可用和访问控制的数据集，科学家可以将其与自己的数据一起存储和分析。该平台使科学家可以使用工作流描述语言（WDL）构建工作流——在基因组学研究中通常使用该工作流创建可以随数据集大小缩放的工作流——以及分析和可视化结果。
可以通过数据集工作台中的点击界面来完成查询数据的某些元素，例如从较大的数据集中分割出特定的同类群组。
为了进一步查询数据，可以将这些队列加载到单独的工作区中，在该工作区中，生物医学科学家可以使用预先装有基本特征分析的Jupyter笔记本进行分析。具有技术头脑的科学家然后可以使用R和Python等语言进行编码，或者使用Hail等工具来对其同类进行进一步分析。还可以将工作空间与其他人（例如实验室的数据科学家）共享，以代替对分析进行编码。
VerilyTerra首席技术官DavidGlazer说：“我可以做任何想做的动手技术工作，同时与其他对我有互补技能的人合作，因为科学是一项团队运动。 ”“团队将拥有各种技能的人们， Terra让他们可以在云中协同工作，以发挥自己的专长，他们需要的工具和数据才能找到研究的真正见解。 ”
Terra的大部分用户来自大学和生物医学科学研究所的学术研究人员，通常遵循BroadInstitute的示例并致力于基因组分析。但是，数据的多样性正在开始增加——客户试图将健康结果与环境和生活方式因素相关联，并尝试合并来自ECG等设备的医学成像和时间序列数据。
毫不奇怪，在当前环境下，流行病学研究也开始了， Terra也用于跟踪不同COVID变体的地理分布。
“现在，比以往任何时候都更需要传染病研究，这是Terra内部关注的重点领域。我们开始在全世界范围内对执行病原体测序以识别新菌株并追踪其病原体的兴趣日益浓厚” ，博德研究所的菲利普帕克斯（Philippakis）说。