Nature Computational Science | 量子计算生物学的实际应用
原标题:NatureComputationalScience|量子计算生物学的实际应用
原创水淼唯信计算6天前
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#量子化学16#计算化学26#计算生物学1
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引言
生物学的许多领域 , 都涉及到解决复杂的计算问题 , 如模拟化学反应、基因组组装、药物发现、蛋白质折叠等 。 尽管计算生物学领域取得了巨大的进步 , 但许多现实生活中的问题 , 仍然具有挑战性 , 因为它们需要大量的计算资源 , 超出了现有设备的能力 。 然而 , 这为开发一个基于完全不同的原理 , 即量子物理定律的计算设备 , 提供了机会 。 例如 , 在量子物理学中 , 一个物体可能同时处于多种状态 , 这种现象被称为量子叠加 。 在计算的语言中 , 量子叠加意味着比特(在这种情况下 , 称为量子比特或量子位)可以同时是0和1 , 这种“并行”的计算过程 。 描述N个量子位元的量子状态 , 通常需要大量的信息 , 按指数尺度按2N扩展 。 在如此大的计算空间中操纵概率振幅的艺术是开发量子算法的核心 , 人们希望量子算法在解决许多不同的任务时提供显著优势 。
今天 , 科学界和工业界都在大力开发量子计算机 , 因为他们坚信量子计算机 , 有能力解决世界上最困难(计算)的问题 。 最近 , 量子优势已经被证明可用于随机电路模拟问题 , 这是一个在生成认证随机数方面 , 具有潜在应用前景的具体问题 。 另一个最近的论证与玻色子采样问题有关 。 讨论了玻色子取样在化学和数学中的应用 。 众多领域有望用于 , 证明量子优势之所在 。 其中之一便是生命科学 , 它正在与大量繁重的计算作斗争 。 由于更精确地模拟生物物体的化学和物理过程 , 以及用于预测和数据处理的新算法 , 从基因组学到药物发现 , 量子计算的潜在改进有望实现 。 这对于量子生物系统来说是特别有趣的 , 因为量子现象的解释对于足够的描述是必要的 , 例如 , 酶催化反应和光收集等 。 Emani等人 , 对量子计算在计算分子生物学中的应用前景进行了详细的回顾 , 从量子计算的基本方面出发 , 为现有的噪声中尺度量子(NISQ)器件和未来的量子计算机发生器的应用提供了广阔的前景 。 这篇综述中 , 研究者论了量子计算对计算生物学、遗传学和生物信息学的潜在影响 , 简要回顾了量子计算 , 并重点讨论了几个潜在应用的具体例子 。
量子计算构架
量子处理器单元(QPUs) , 可认为是计算设备中额外的协处理器 , 可增强经典处理器单元(CPUs)的现有加速器 , 例如 , 现场可编程门阵列和图形处理单元(GPUs) 。 因此 , 可通过使用QPUs , 来解决那些基于经典原理的设备无法解决的问题 。
1.1基于门的(数字)量子计算机
基于门的QPU体系结构(也称为数字模型)在概念上看起来 , 与现有的经典计算设备的体系结构相似 。 量子信息的单位是量子位 。 经典位元的值可以是0或1 , 而量子位元可以是两种经典态的线性叠加 。 基于量子门的量子计算机的思想是 , 在量子位下 , 实现量子算法作为逻辑操作序列的量子门 。 然而 , 与经典比特不同的是 , 一个由N个0和1组成的字符串就足以描述N个比特的状态 , 而一个由N个(纠缠)量子位组成的物理系统需要2N个复数 。 另一个不同之处在于 , 量子算法的实现以测量为终点 , 这导致了不可逆的干扰 。 为了实现量子算法 , 人们必须能够准备初始量子态 , 实现量子逻辑门的通用集合 , 实现系统状态的测量 。
理想情况下 , 基于门的量子计算机的计算能力是通过量子位的数量来衡量的 。 然而 , 在现实中 , 量子位元的状态受到噪声(由退相干效应引起)的影响 , 这限制了量子位元操作的数量和质量 。 退相干会导致错误 , 例如位反转和相位反转 。 由于不克隆定理的存在 , 开发量子纠错码具有挑战性 。
目前这一代基于门架构的量子计算设备 , 属于NISQ的时代(见图1) , 所以它们有大约50-100个量子位 , 没有纠错工具 。 这些设备已经解决了超出现有经典计算设备能力的计算任务 。 然而 , 它们在解决有用的计算问题上 , 仍然没有表现出优势 。
最终的目标是开发一种容错量子计算机(FTQC) , 可通过实现有效的纠错技术 , 或者通过创建不受退相干影响的量子位(例如 , 拓扑保护的量子位) 。 FTQCs承载没有生命周期限制的量子位 , 所有操作都可以在没有错误的情况下执行 。 这个目标就是量子计算的圣杯 。
1.2绝热量子计算机
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