新闻头条所有国家几乎同时传播，英国研究：新冠最早始于去年十月( 二 ) 近日

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7666个全球测序的SARS-CoV-2基因组采样时间与病毒进化的关系，图c为放射状图
研究人员称，在收集数据的时间范围内，如果存在可衡量的进化过程，则采样时间与进化过程之间的正相关关系就会出现。具体而言，与最近的共同祖先病毒相比，越新分离出的病毒株在基因组中积累的变异就越多。
对采样日期与病毒进化过程之间的回归原点分析显示，病毒基因组最近的共同祖先（theMostRecentCommonAncestor ， MRCA）大约在2019年底左右出现。
通过进化模型“分子钟”估算软件TreeDater等，研究人员观察到一个病毒基因组最近的共同祖先，其出现时间大概在2019年10月6日至2019年12月11日，这与新冠肺炎流行的开始时间相对应。
研究人员指出，这一时间区间与此前使用各种计算方法在新冠病毒基因组数据的较小子集上进行的估计大致相同，但由于数据集规模庞大、一些更复杂的推理方法无法使用，这一结果仍应谨慎采信。
研究团队还发现，在当前阶段的新冠肺炎大流行中， SARS-CoV-2基因组仅积累了中等程度的遗传多样性，任意两个基因组之间的平均SNP（单核苷酸多态性）成对差异为9.6 。这意味着，新冠病毒基因组的共同祖先出现的时间不长、相对较新。
几乎同时在所有国家被引入和传播，在首例感染后快速地扩散
研究人员用“一切无处不在（Everythingiseverywhere）”来形容在多个国家发现的新冠病毒基因组的特征。
事实上，英国、美国、冰岛、澳大利亚等大多数国家中发现的SARS-CoV-2基因组多样性基本概括了7666个基因组数据集中COVID-19的全球多样性。

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英国、美国、冰岛和中国发现的SARS-CoV-2基因组全球遗传多样性的比例
这意味着，新冠病毒在这些国家成为本地流行病都是通过大量独立的病毒基因组进入并传播造成的，几乎是同时在所有国家被引入和传播，且在首例感染后快速地扩散。中国是一个例外，虽然被普遍认为是新冠疫情的最初暴发地，但实际上中国的新冠病毒基因组仅包含全球多样性的一小部分。
通过关注独立多次出现的同源性突变，研究团队确定了SARS-CoV-2基因组中的198个的频发突变（recurrentmutation），这些突变可能标志着基因趋同进化，并且在适应性背景下使SARS-CoV-2特别容易感染人类宿主。近80％的频发突变在蛋白质水平上产生了非同义的变化，研究者们认为，这表明SARS-CoV-2还在持续发生突变以适应人类。
SARS-CoV-2的结构包括分为两部分的、编码非结构蛋白的开放阅读框（ORF）；四种结构蛋白：刺突（S）、包膜（E）、膜（M）和核壳（N）；以及一组小的附属因子。研究人员发现发生频发突变的上述198个位点（占所有位点的0.67％）与7666个基因组中的290个氨基酸变化相关。在这些氨基酸变化中， 232个包含非同义突变， 58个包含同义突变。