健康智多星啊|《自然·癌症》：液体活检用于免疫治疗获重大突破！

免疫治疗给30%左右的晚期癌症患者带来了希望，遗憾的是，临床医生在治疗前也不知道究竟哪些患者属于那能获益的一小部分。
今天，加拿大玛格丽特公主癌症中心Trevor J. Pugh和Lillian L. Siu领衔的研究团队，在《自然·癌症》上发表重要研究成果[1] ，或许能帮助医生更准确地寻找从免疫治疗中获益的癌症患者。
【健康智多星啊|《自然·癌症》：液体活检用于免疫治疗获重大突破！】他们发现，在接受免疫治疗的过程中，肿瘤释放到血液中的循环肿瘤DNA（ctDNA）水平的变化，可以预测患者对免疫治疗的反应[1] 。
具体来说，在接受3个疗程及以上的抗PD-1抗体治疗后，如果患者的ctDNA水平下降，则意味着免疫治疗疗效好，患者能存活的时间更长；尤其值得一提的是，那些在接受免疫治疗之后检测不到ctDNA的存在的患者，他们的获益最大，生存时间最长[1] 。
此外，他们还发现，通过检测ctDNA的变化要比放射学方法能提前数月得知患者对免疫治疗的反应[1] 。

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▲ 论文截图
对于晚期癌症患者而言，准确地判断他们能否从免疫治疗中获益非常重要，一方面因为免疫治疗有一定的毒副作用，另一方面免疫治疗价格不菲。早期确定患者对免疫治疗的反应，就能让不能获益的患者免于承受毒副作用和高昂的治疗费用。
实际上科学家也找到了不少预测免疫治疗疗效的生物标志物[2] ，只不过这些标志物的预测能力都太一般，实在是不足以准确地找出能从免疫治疗中获益的患者。
Pugh和Siu领导的研究团队想改变这一现状，他们打算以外周血中的ctDNA为切入点，因为已经有些处于原理验证阶段的研究表明， ctDNA与患者的反应和疗效有相关性[3-4] 。
总体看来ctDNA是有预测患者对免疫治疗反应的潜力的，但是临床上还缺少证据。
因此， Pugh和Siu团队发起了一个名为INSPIRE的前瞻性2期临床研究（ NCT02644369），以评估ctDNA检测在预测抗PD-1抗体治疗效果方面的能力。

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INSPIRE研究包括五个平行队列：头颈部鳞状细胞癌（SCCHN）、三阴性乳腺癌（TNBC）、高级别浆液性卵巢癌（HGSOC）、恶性黑色素瘤（MM）和混合实体瘤（MST）。
一共有106名患者入组，所有患者都接受抗PD-1抗体pembrolizumab的治疗，治疗周期在1-35之间，中位治疗周期是3 。其中94名（89%）患者有足够的肿瘤组织进行外显子组测序，外显子组测序是为了了解患者肿瘤中存在的体细胞突变，以便确定ctDNA检测的基因突变。
研究人员基于每个患者肿瘤组织中的体细胞突变情况，分别定制个性化的ctDNA突变检测目标，每个患者需要检测的ctDNA突变都不超过16个[8] 。
在确定每个患者的检测目标之后，研究人员就分析了在患者治疗过程中采集的血样。最后除了两名患者的血浆中没有检测到指定的ctDNA突变之外，其余92名患者都确定了基线ctDNA水平（研究人员把它称为ctDNAB）。
从基线ctDNA水平来看，如果患者的基线ctDNA低于中位基线ctDNA的话，这些患者的总生存率（OS）更好（aHR：0.49），无进展生存率（PFS）也更好（aHR：0.54）。而且基线ctDNA水平低患者群体的临床获益率（CBR）和客观缓解率（ORR）也相对更好。

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▲ 基线ctDNA高低与OS、PFS的相关性
接下来Pugh和Siu团队思考的问题是，治疗早期ctDNA水平的变化是否可以预测免疫治疗的获益情况。分页标题
为了回答这个问题，研究人员又分析患者在接受至少3个周期pembrolizumab治疗后的ctDNA水平（ctDNAC3），只有73名患者有这个数据。
在这73名患者中，有33名患者的ctDNA水平较基线出现下降，其中14人病情达到客观缓解；而在40名ctDNA水平较基线出现上升的患者中，只有1人出现客观缓解（OR：28.74）。

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▲ 患者的基本情况汇总（红色小点是下降，蓝色小点是上升）
而且，治疗3周后的ctDNA水平较基线下降也与更高的CBR ，更好的OS和PFS有关。

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▲ ctDNA的动态变化与OS和PFS之间的关系
在随后的研究中，研究人员还发现，治疗后ctDNA水平下降作为一个预测标志物，独立于肿瘤突变负担（TMB）和PD-L1表达水平。此外，如果在治疗第三个周期将ctDNA水平的变化与实体瘤的疗效评价标准（RECIST）结合时使用的话，患者的风险分组更准确，预测的OS也更准。

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▲ RECIST与ctDNA动态变化联合给患者做风险分组
在研究的最后， Pugh和Siu团队更细致地评估了具有不同ctDNA动态特征的患者的临床结果。
他们发现，如果在监测期间ctDNA水平比基线有所上升，无论上升多少，都与大多数患者的疾病快速进展和生存期差（中位OS为13.7个月）相关；如果监测期间ctDNA水平低于基线，但仍可检测到的话，患者对免疫治疗的反应表现不一，生存期稍长（中位OS为23.8个月）。
最让研究人员感到吃惊的是，如果ctDNA在治疗过程中被清除，也就是突然检测不到ctDNA了，那么这些患者的临床预后非常好，在中位随访时间长达25.4个月的时间里，患者的OS达到100% 。

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▲ ctDNA的变化程度与OS的关系
此外，研究人员还发现，在治疗期间同时出现放射学反应和ctDNA清除的患者身上， ctDNA清除的出现先于放射学的变化。这也表明，与放射学手段相比，监测ctDNA水平的动态变化在预测免疫治疗效果上可能更有优势。

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▲ ctDNA消除与放射学方法的比较
基于以上研究数据， Pugh和Siu认为：使用定制化的检测方法进行连续ctDNA分析，可以作为免疫检查点抑制剂疗效预测的一种值得推广的监测策略。
此外，本研究的结果还显示， ctDNA水平在早期上升与较高的进展率相关。在ctDNA不断增加的情况下，患者对免疫检查点抑制剂的客观反应可能是极其罕见的。
如果将早期ctDNA动力学特征与实体瘤的疗效评价标准（RECIST）联合使用，或许可用于识别那些ORR为0% ，不太可能从免疫检查点抑制剂单药持续治疗中获益的患者。
当然，以上研究成果在投入临床使用之前，还需要进行干预性研究。不过，由于这种方法不仅需要做肿瘤组织的外显子组测序，还需要连续多次ctDNA检测，价格一定不菲，希望测序价格能进一步下降，以惠及更多患者。
参考文献：
[1].https://www.nature.com/articles/s43018-020-0096-5
[2].Jenkins R W, Thummalapalli R, Carter J, et al. Molecular and genomic determinants of response to immune checkpoint inhibition in cancer[J]. Annual Review of Medicine, 2018, 69: 333-347.
[3].Lee J H, Long G V, Menzies A M, et al. Association between circulating tumor DNA and pseudoprogression in patients with metastatic melanoma treated with anti–programmed cell death 1 antibodies[J]. JAMA oncology, 2018, 4(5): 717-721. 分页标题
[4].Lee J H, Long G V, Boyd S, et al. Circulating tumour DNA predicts response to anti-PD1 antibodies in metastatic melanoma[J]. Annals of Oncology, 2017, 28(5): 1130-1136.
[5].Goldberg S B, Narayan A, Kole A J, et al. Early assessment of lung cancer immunotherapy response via circulating tumor DNA[J]. Clinical Cancer Research, 2018, 24(8): 1872-1880.
[6].Anagnostou V, Forde P M, White J R, et al. Dynamics of tumor and immune responses during immune checkpoint blockade in non–small cell lung cancer[J]. Cancer research, 2019, 79(6): 1214-1225.
[7].Cabel L, Proudhon C, Romano E, et al. Clinical potential of circulating tumour DNA in patients receiving anticancer immunotherapy[J]. Nature reviews Clinical oncology, 2018, 15(10): 639-650.
[8].Coombes R C, Page K, Salari R, et al. Personalized detection of circulating tumor DNA antedates breast cancer metastatic recurrence[J]. Clinical Cancer Research, 2019, 25(14): 4255-4263.
本文作者 | BioTalker