imagej灰度分析使用步骤 imagej灰度分析结果( 二 )


File -> Save as Gif可以创建3D效果的动图 , SCI论文中可以用这种方法来显示三维动态效果:
5 Stack图像绘制Z轴剖面图
Z轴剖面图可以获得选择ROI(感兴趣区)的平均灰度值 , 方法为:
Image -> Stacks -> Plot Z-axis Profile…
使用矩形、椭圆、不规则或自由形状工具在confocal-series.tif中绘制ROI:
点击Plot Z-axis Profile 获得结果Live即可得到实时ROI对应的Z轴剖面图:
应用实例:
分析时间序列图像 。下图是Elife(IF=7.616)中记录时间依赖的钙成像 , 横坐标是时间纵坐标是钙信号 , 反映的是不同时间点钙信号的动态变化:
步骤:
1、 ImageJ打开时间序列Stack图像 , Z轴为时间:
2、 添加感兴趣的ROI , Image -> Stacks -> Plot Z-axis Profile…即可得到ROI荧光强度随时间的变化:
点击List得到ROI荧光强度随时间的变化的数值 , 保存数据可进行重新绘图:
【imagej灰度分析使用步骤 imagej灰度分析结果】今天给大家分享了ImageJ分析Stack图像的基本操作及其实际应用 , 希望对大家有所帮助!