经过李莲英的煽风点火慈禧更愿意相信，虽然，这种折子不一定是文廷式的计划，但是，很难说寇连材没有被文廷式影响。所以，慈禧立即出手将寇连材交给刑部，并且，明确表示了一个字：“斩”。从那时起，慈禧就让光绪皇帝辞退了文廷式，将他赶出了京城。根史料的记载，寇连材被送往了菜市口。临死前，寇连材“神色不变，整衣冠，正襟领，望阕九拜，坦然地说：‘如此足千古’，乃就义”，从这一点来看，也确实具有一定的“英雄色彩”。虽然，寇连材与改革者没有什么关系，但是，他的行为却得到了大多数人的称赞。
虽然，慈禧十分生气，但是，根据一些野史显示，其实，慈禧还是曾想饶过寇连材一条狗命，所以，在审讯期间，慈禧故意给了他一些退路。但是，寇连材却充满了雄心壮志，并视死如归，面对如此愤怒的青年，慈禧最终还是成全了他。
在封建专制社会，统治者要求每个人都要按照自己的职责行事，更不能挑战现有的秩序。此外，在慈禧眼中，寇连材只是一个被阉割的奴才，甚至，是一个奴隶。所以，他既是奴隶，就要全心全意做好奴隶，不能有任何别的心思。虽然，慈禧知道寇连材完全是爱国忠诚，但是，她更需要杀鸡儆猴。慈禧的意思也是显而易见的，国家事务一直是成人的专利，而不是一个阴险太监可以影响的。因此，不管寇连材多么忠君爱国，他都是这个专制体制下的受害者。
此外，在这个体制的祭坛上，寇连材不是第一个受害者，也不是最后一个。

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