随着年代测定技术的进步以及更多样本的取得，在地质学界一种共识逐渐形成，那就是火山岩浆的喷发可能是导致二叠纪末期大灭绝的真正元凶——尤其是在一些科学家经过研究之后发现当时西伯利亚地区岩浆喷发活动的持续时间应为100万年左右，而不是此前认为的1000万~5000万年。


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地质学家们把怀疑的目光投向了火山喷发事件，认为其可能是造成二叠纪末期生物大灭绝事件的元凶地球生命的灭顶之灾
那次空前的岩浆喷发活动所造成的灾难是极端严重的，而在海洋中，灾难导致的后果尤其严重，海底更是重灾区。
很多物种整个大门类都被完全消除掉了，其中就包括目前已知最早出现的节肢动物——三叶虫，另外也包括一些原始的皱襞珊瑚和横板珊瑚，以及一些棘皮动物，比如花生形状的海蕾，它们是今天海胆和海星的近亲。其他一些，比如腕足类、苔藓虫以及和乌贼类似的菊石类动物、花朵形状的海百合类动物等等。
而相比之下，那些游泳生物的处境则相对稍好一些。尽管其中的一些种类，如棘鱼和盾皮鱼依然灭绝了，但更多其他种类的鱼类，以及身体长得和今天的鳗鱼可能有些相似的牙形石类动物则成功地存活了下来。
而当时那些生活在陆地上的生物也同样遭遇了灭顶之灾。和海洋生物一样，很多陆生生物的种属也都被完全抹掉了，其中包括长着军刀般的尖牙，当时陆地上的食肉动物霸主丽齿兽，以及体型相对较大，食草的巨颊龙类动物。
根据俄罗斯莫斯科古生物研究所的德米特里·谢科巴诺夫（Dmitry-Shcherbakov）的说法，当时生活在二叠纪晚期的昆虫类生物中，大约有40%的种属就此消失了。很多原先生活在赤道地区的昆虫种属，如蟑螂和蝉，随着气温的升高，逐渐向北半球较高纬度地区扩散迁移。


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严重的酸雨将对森林造成严重破坏
而在植物方面，有证据显示在当时所有的森林几乎完全消失了。
在当时占据统治地位的裸子植物种属中，很多开始就此衰落。在这一时期跨度长达1000万年左右的地层中没有发现煤炭，显示当时缺乏能够形成泥炭类沉积的植物。
另外一项可以指示当时在植物界发生的严重情况是所谓的“二叠纪末真菌爆发事件”（fungal-spike）——当时地层中发现真菌孢子化石的数量急剧增加。
英国诺丁汉大学的巴里·洛麦克斯（Barry-Lomax）表示：“这一现象可以解释为当时大量真菌生长在已经枯死或即将枯死的树木枝干上。这种现象在其他地层中是不曾出现的。”
两阶段灭绝事件

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