构建微生物发酵床猪舍时，需要考虑六个因素：
（1）饲养密度要恰当，一般以每头猪占地1.2～1.5米2为宜，小猪可适当增加饲养密度 。
（2）发酵床床面要保持一定的湿度，使之经常保持在60%左右，如水分过多应打开通风门排湿；如过于干燥，可通过定期喷洒活性剂进行调节 。
（3）生猪入圈前要先驱虫，防止将寄生虫带入发酵床，使猪重复感染发病 。
（4）要密切注意土壤微生物菌的活性，及时补充微生物原种和营养液；每批猪出栏时，菌床一般要降低10厘米左右，应及时补充填料 。
（5）饲料投喂，不可过量，每次投喂量应控制在正常量的80%，以利于猪拱翻地面 。粪尿成堆时，可挖坑掩埋 。
（6）猪舍内禁止使用化学药品，防止伤害土壤微生物，影响微生物活性 。
优良的发酵菌床可以连续使用5年左右，不用清理，猪粪只需每天翻埋一次 。

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