科研 | CLIN CANCER RES：来自超重或肥胖供体的FMT用于晚期胃食管癌恶病质患者( 三 )

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图4. DCR (A), 总生存期 (B), 无进展生存期 (C), 意向性分析。 A, DCR: 同种异体 vs 自体FMT (P=0.035) 。 Kaplan–Meier评估1年生存率(B) 和PFS (C)随机接受同种异体（蓝色）或自体（红色）FMT的患者。 R, 应答者（病情稳定或部分应答）；NR, 非应答者（进展）。 5 FMT对肠道菌群组成的影响接下来，我们分析了FMT对两组肠道菌群组成的影响（n=23），只排除了一名因便秘而未接受自体FMT的参与者。令人欣慰的是，在基线（V1）和4周（V2）之间，同种异体组的二进制Jaccard指数显著下降（P=0.01），而自体FMT组中没有出现这种情况（图5A）。第二， FMT后存在明显的供体种移植，定义为供体种存在，受体种在FMT前不存在，在FMT后存在（补充图S3）。因此，与基线相比，在FMT后，同种异体受体的微生物组组成与供体微生物组相比更接近。为了进一步探讨FMT对肠道微生物群整体组成的影响，我们采用了多水平PCA ，检测了肠道微生物群组成的个体内变异（即，与FMT后4周和12周观察到的微生物群组成相比， FMT前的基线微生物组成）。同种异体组在FMT后出现了明显的移位，而自体组未发现这种移位（图5B）。我们通过识别特定的细菌种类和/或细菌群落，加深我们对异体FMT组中DCR改善的生理机制的理解，与自体FMT组相比，异体FMT组中细菌种类和/或细菌群落富集或缺乏。然而，在三次访问中接受同种异体或自体FMT的患者之间的任何α-多样性指标均未发现显著差异（Shannon指数与物种丰富度;补充图S4）。此外，肠道菌群多样性（包括α和β多样性）与DCR、OS或PFS均无显著相关性（补充图S5）。同样，在同种异体FMT后的4周或12周，没有发现单个物种或功能相关物种组与DCR、OS或PFS相关（补充图S6-S7）。基于第4周获得的粪便样本的DCR机器学习模型也没有预测价值（AUC：0.52；前15名微生物；补充图S8）。
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图5. FMT对肠道菌群组成的影响。 A, 同种异体组的Jaccard距离。 Jaccard距离度量了样本集之间的不同（以二进制的方式：存在或不存在）。 Jaccard距离越大，受者与供者的肠道菌群组成差异越大。距离越小，越相似。与基线相比，在第4周和第12周， Jaccard距离显著减小（例如，相似性的增加）。因此，接受同种异体FMT的患者的肠道微生物群组成与供体的肠道微生物群组成更加相似。 B, “多水平”PCA: 只描述了个体内部的方差。同种异体受试者(左)显示FMT后微生物组组成发生变化；自体受试者没有明显的转移。6 FMT对血浆代谢物的影响为了进一步阐明同种异体FMT有益作用的潜在代谢机制，我们探讨了FMT后血浆代谢物的变化。我们发现化疗对血浆代谢组有显著影响，在基线、第4周和第12周之间的多水平PCA图中可见显著移位（补充图S9）。然而，在两个干预组之间没有明显的差异。结果表明，我们没有观察到在两组干预组之间有显著差异的特异性血浆代谢物，也没有发现与同种异体供体FMT后的DCR相关。基于第4周（AUC：0.49）或第12周（AUC：0.60；两种模型的前15中种微生物；补充图S10-S11）抽取的血浆样本，该模型是一个较差的预测DCR的指标。讨论