【文献解读】新英格兰杂志综述:NGS用于诊断疑似遗传病( 二 )
临床NGS可作为诊断的工具
用于临床NGS的实验室技术已经在许多综述中提过 。
1.sanger仍然是测序金标准 。 但从684个样本的5个基因测序结果来看 , 全外显子组测序(Whole-Exome Sequencing , WES)测序结果的验证率已达99.97%;此外 , 对于高质量WES测序区域获得的不一致结果 , WES数据正确的可能性高于Sanger测序数据 。
2. Panel测序靶向与特定临床表型相关的几组基因 , 表型范围可能很窄(如家族性高胆固醇血症检测组合中的4个基因) , 也可能很广(如智力障碍检测组合中超过1,000个基因) 。
3.全基因组测序(Whole-Genome Sequencing , WGS)产生序列数据的区域是WES覆盖区域的50-100倍 , 包括调控区、内含子区和基因间区 。 与WES相比 , WGS能够对某些区域有更一致的测序结果 , 但是临床上不推荐首选WGS , 因为WGS配套的生物信息学工具远没有WES工具完善 , WGS测序的费用仍然很高 , 且数据管理成本和分析费用很高;
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