（3）唯一的跨膜ATG蛋白（ATG9A），为自噬体提供膜结构；

（4）参与早期自噬体膜延伸的WIPI蛋白及结合蛋白，ATG2A与ATG2B；

（5）参与自噬体膜延伸与完成的两个泛素样蛋白共轭系统：ATG12-ATG5，ATL16L1与LC3亚家族（酵母中为ATG8）。

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自噬相关基因依赖的膜转运途径（Autophagy Gene-Dependent Membrane Trafficking Pathways）【1】

需要注意的是这种分类并不是绝对的，不同的ATG蛋白结合也会发挥出其他的功能，如ATG13可以通过招募ATG9参与自噬体的结构。另外自噬体不仅需要ATG的参与还需要与溶酶体融合才能完成溶酶体降解。正确的融合需要多因素的参与，包括溶酶体pH改变、细胞骨架马达蛋白、tethering因子(HOPS复合物, Rab GTPase, RAB7)，SNARF蛋白，磷脂、LC3/GABARAP家族等。

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