nature子刊 | 合成生物学重大突破:让细菌具有社会属性

6月25日,国际学术期刊

Nature Chemical Biology

线发表了Broad institute的James J. Collins组和UIUC的Ting Lu组的合作研究成果

“Designing microbial consortia with defined socialinteractions”



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设计混菌体系是合成生物学的新兴前沿,可实现多功能的微生物组工程。然而,由于我们在快速创造具有理想动态的生态系统方面的能力有限,这些混菌体系的利用常受阻碍。研究者通过将模块化代谢途径重构与建模相结合的社交互动工程来完成合成混菌体系的开发。

具体而言,研究者创建了

六个双菌混合体系

,每个混菌体系拥有独特的互动模式,包括共栖,偏害共生,中立,合作,竞争和掠夺。这些混菌体系遵循不同的种群数量动态,其特征由潜在的交互模式决定。研究表明,来源于两菌株混菌体系的模型可用于设计具有可预测行为的三和四菌株生态系统,并进一步扩展以提供对空间群落动态的探索。这项工作揭示了相互作用微生物物种的组织关系,并提供了系统框架以指导为各种目的开发的综合生态系统。

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