该计划正联合各国科学家对癌症基因组幵展研究 ， 绘制较为完整的人类癌症基因图谱 ， 包括50种不同类型的癌症 ， 每种癌症500个标本 ， 总共25000个 。

23、癌症患者的基因图谱 。
从基因组学、表观遗传学、转录等方面分析癌症的发生发展 ， 并希望得到所有与癌症相关的基因突变的图谱 。
在此计划中 ， 中国负责胃癌的基因组测序 ，而美国负责脑癌、卵巢癌和胰腺癌等 。
价值和意义：1 ）创立一个免费使用的基因组大数据 。
这将有助于加速癌症研究 ， 比如笔者利用TCGA数据总结了12个癌基因在中国8大常见肿瘤中的突变率（图6） ， 可以清楚看出这些基因在不同癌症的突变情况以及不同基因在同一癌症的突变组合图谱 。
每种癌症都是不同的 。
就RAS基因来说 ， 在约30%的非小细胞肺癌、50%的结肠癌、10%的胃癌发现其突变激活；2）用于精准医疗 。
数据被用来将癌症基因组学和临床更好的整合 ， 直接鉴定基 。

24、因型一临床表型的相关性 ， 幵发更好的计算模型 ， 从而选择最佳治疗方案；3 ）基因大数据用来寻找新的基因突变并幵发相应的新药 ， 即新的靶向治疗药 。
比如 ， 治疗慢性髓样白血病的一线药物格列维克（Gleevec ）为人类历史上第一个成功研制的小分子靶向药物并首个被批准应用于临床 。
此病的发生是由于两个不同的染色体断裂且) ， 其结果是形成了BCR/ABL 融合基因及相应的具有高激酶活重新配对形成所谓的“费城染色体” (Philadelphia chromosome性的融合蛋白 ， 构成疾病的重要发生机制 。
格列维克能够靶向抑制BCR-ABL ， 从而有效治疗此型白血病 。
另1例是几年前发现IDH1和IDH2基因在许多癌症发生 。

25、突变 ， 生物医药公司(包括诺华Novartis )幵发了针对IDH1和IDH2突变的靶向治疗药物 ， 现在已经处于临床试Fig. 6 Mutati on rates of 12 can cerO, ib图6 12个癌基因在中国8大常见肿瘤中的突变率genes in 8 com mon types of can cers in China* MM3.2癌症组学类技术主要包括基因组学(genomics)、蛋白组学(proteinomics)、代谢组学( metabolomics )、转录组学( transcriptomics)、RNA 组学(RNomics )、脂类组学( lipidomics )、免疫 。

26、组学(immunomics)和糖组学(glycomics )等 。
毋庸置疑 ， 基因组学或基因突变及其检测方法研究已成为生物学研究和临床精准医疗的热点和基础 。
癌相关基因变化的形式主要有点突变、小缺失、插入、染色体易位或逆转、杂合性丧失、扩增、甲基化及染色体非组蛋白改变等 。
精准医疗并不单纯是DNA测序 ， 如针对人类表皮生长因子受体2 ( HER-2 )状态的检测方法包括传统免疫组化和荧光原位杂交(FISH ) 。
癌基因和抑癌基因的激活和失活有多种表现形式 ， 其中基因产物过度表达为重要形式之一 ， 可表现为mRNA 和蛋白质量的增加 ，此外 ， 基因扩增可表现为基因拷贝数的增加 ， 这些基因表达的异常 ， 均可加以检测并作为 。

27、靶向药物的生物标志物(表1 ) 。
表1常用肿瘤靶向药物和相应的伴随生物标志物Table 1Com mon tumor-targeted drugs andtheircorresp onding compa nion biomarkers1) 生物芯片技术( microarray ) 。
把生物信息片段或成分打印在支持介质表面的微阵列杂交技术 ， 可以说是产生大数据的首个高通量生物技术 。
现有的芯片包括DNA、RNA、蛋白质、糖分子、甲基化、细胞和组织等类型 。
随着第二代测序技术的问世 ， 某些类型芯片如 DNA芯片已逐渐被冷落 ， 但因其技术和分析工具的成熟性 ， 仍有临床精准医疗应用的价值 。
而且 ， 此技术在生物感测器( 。

28、biosensor )等方面的幵发和应用前途无量 。
另外改造的液相芯片(见Panomics 和NanoString技术)为此技术增加了新的活力并可广泛应用于精准医疗 。
2)第二代测序技术(next-generation sequencing ，NGS ) 。
一个能生成高达500千兆碱基数据( gigabases )的大规模平行测序技术 。
该技术是TCGA和ICGC绘制完整的人类癌症基因图谱的主要工具 ， 可以检测单核苷酸变异、插入或缺失、拷贝数异常、结构变异、基因融合、甲基化及表达 。
第二代测序在科学和技术领域迅速获得认可 ， 已成为一个重要研究平台 。
图7显示的是目前市场上的几个主要测序平台或仪器的代表 。
因为第 。

29、二代测序的样品制备过程非常复杂并且生成的序列数据难处理 ， 对将其应用于临床基因诊断带来许多障碍 。
Fig. 7 Several major图7市场上主要高通量第二代测序平台或仪器及其生产厂家high-throughput n extge nerati on seque ncing platforms or in strume nts an dtheir manu facturers curre ntly on the market3） Panomics技术 。

来源：(未知)

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标题：肿瘤|肿瘤的精准医疗概念、技术和展望( 四 )