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同源性|同源性检测矩阵法的建立及应用( 四 )


按关键词阅读: 应用 建立 矩阵 检测 同源性


3 1Met aug 1 2 1 3 3 7 1 3 20 38若考察 TP 的双元素集合 , S 。

29、与 T1 、T2的同源程度最小 , 其 | H |3Ileaua 2 11 2 6 5 11 2 5 16 39的值为 488. 16;
若考察 TP 的三元素集合 , S与 T 、T 、T 的同auc6 14 6 10 8 5 6 8 17 39 auu 4 12 4 3 10 18 4 10 25 42Glncag7 27 7 6 12 8 7 12 16 33 caa6 20 6 6 12 6 6 11 14 27Hiscac6 11 6 6 8 7 6 9 6 286 1 2 3源程度最小 , 其 | H | 的值为 5 753. 10;
若考察 TP 的四元素集 合 , S2 与 T1 、T2 、T 。

30、3 、T4 的 同 源 程 度 最 小 , 则 其 | H | 的 值 为32 527. 34 。
cau5 21 5 3 7 8 5 7 25 20对 SP 的双元素集合 , 在 TP 的单元素集合中 , S 、S与 T113Pro ccg 0 16 0 6 1 5 0 1 4 46 的同源程度最小 , 其 | H | 的值为 3. 83;
在 TP 的双元素集合中 , PS1 、S3 与 T1 、T2 的同源程度最小 , 其 | H | 的值为 747. 66;
在 T的三元素集合中 , S4 、S5 与 T1 、T2 、T3 的同源程度最小 , 其 | H |不高 , 并且它们彼此之间的差异值也都比较大 , S2 、S4 间的差。

31、异已经高达 89. 250%。
根据这个结果绘制出系统发生图 , 如的值为 10 212. 41;
在 TP 的四元素集合中 , S 、S与 T 、T 、T 、图 1 所示 。
故集合 S 、S 、S 、T 、T 即为基于 MEGA 4. 0 这261231 3 5 1 2T4 的同源程度最小 , 其 | H | 的值为 57 881. 84 。
1对于 SP 的三元素集合 , 如果考察 TP 的单元素集合 , S 、S3 、S5 与 T2 的同源程度最小 , 其 | H | 的值为 745. 74;
如果考察一分子生物学分析软件在给定两集合中搜索出的同源性最高的序列集 。
序列S1S2S3S4S5S6T1T2T3 T4S1S2 。

32、90. 193S30. 00390. 508S493. 98489. 25093. 865S50. 01590. 4790. 01493. 842S692. 19787. 24192. 3939. 44892. 425T10. 00490. 1590. 00293. 7270. 01692. 542T20. 02090. 5100. 01893. 8820. 00692. 7520. 021T311. 59815. 48911. 4089. 51511. 50911. 40711. 61612. 014表 4 使用 MEGA 对集合 S 与 T 中序列的同源性分析TP 的双元素集合 , S 、S。

33、、S与 T 、T的同源程度最小 , 其 | H |1 3 5 1 2的值为 1 242. 33;
如果考察 TP 的三元素集合 , S 、S 、S与 T 、1 3 5 1PT2 、T3 的同源程度最小 , 其 | H | 的值为 13 902. 08;
如果考察 T的四元素集合 , S2 、S4 、S6 与 T1 、T2 、T3 、T4 的同源程度最小 , 其| H | 的值为 83 179. 52 。
1基于 SP 的四元素集合 , 对于 TP 的单元素集合来说 , S 、S3 、S4 、S5 与 T1 的同源程度最小 , 其 | H | 的值为 2 599. 33;
对于TP 的双元素集合来说 , S 、S 、S 、S与 T 、 。

34、T的同源程度最小 , 1 3 4 5 1 2T4 94. 541 15. 066 94. 418 12. 021 94. 449 12. 897 94. 514 94. 433 88. 643其 | H | 的值为 4 199. 07;
对于 TP 的三元素集合 , S 、S 、S 、S 与1 3 4 5PT1 、T2 、T3 的同源程度最小 , 其 | H | 的值为 19 773. 90;
对于 T的四元素集合来说 , S2 、S4 、S5 、S6 与 T1 、T2 、T3 、T4 的同源程度 最小 , 其 | H | 的值为 107 092. 5 。
1在 SP 的五元素集合中 , 若就 TP 的单元素集合而言 , S 。

35、 、S3 、S4 、S5 、S6 与 T2 的同源程度最小 , 其 | H | 的值为 5 504. 15;
若就 TP 的双元素集合而言 , S 、S 、S 、S 、S与 T 、T的同源程1 3 4 5 6 1 2度最小 , 其 | H | 的值为 8 495. 57;
若就 TP 的三元素集合而言 , S1 、S3 、S4 、S5 、S6 与 T1 、T2 、T3 的同源程度最小 , 则其 | H | 的值为26 022. 82;
若就 TP 的四元素集合而言 , S 、S 、S 、S 、S与 T 、4 对比分析1 3 4 5 6 1T2 、T3 、T4 的同源程度最小 , 其 | H | 的值为 148 088.。

【同源性|同源性检测矩阵法的建立及应用】36、72 。
1就 SP 的六元素集合来说 , 若考察 TP 的单元素集合 , S 、S2 、S3 、S4 、S5 、S6 与 T2 的同源程度最 小 , 则 其 | H | 的 值 为本文用每种氨基酸各同义密码子个数的差异程度作为两 两序列间同源程度的度量标准 , 这从一个新的视角丰富了同源 性的检测标准 , 并提出矩阵法 , 将其运用于逐步搜索过程 , 整个15 705. 23;
若考察 TP 的双元素集合 , S 、S 、S 、S 、S 、S与 T 、1 2 3 4 5 6 1T , 其 | H | 的值为 26 654. 82;
若考察 TP 的三2 的同源程度最小元素集合 , S1 、S2 、S3 、S4 、S5 、S6 与 T1 。

37、 、T2 、T3 的同源程度最小 , 其| H | 的值为 46 799. 99 。
S 中所有的序列与 T 中所有序列的 | H |的值为 179 789. 58 。
根据上述一系列数据分析 , 归纳出的最终结论是: 序列集 S 中 , S1 、S3 、S5 的同源程度最高 , 序列集 T 中 , T1 、T2 的同源程 度最高 , 因此集合 S1 、S3 、S5 、T1 、T2 即为将矩阵法运用于逐步 搜索过程所搜索出的同源性最高的序列集 。


来源:(未知)

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标题:同源性|同源性检测矩阵法的建立及应用( 四 )


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