苏联最终没能同中国就西段边界达成最后协议。苏联解体后，原中苏西部边界分别成为中国与俄罗斯、哈萨克斯坦、吉尔吉斯斯坦以及塔吉克斯坦四国的边界(其中中俄边界为50公里、中哈边界为1700公里、中吉边界为1000公里、中塔边界为400多公里)。1992年10月起，在中苏谈判已定原则和已达成协议的基础上，中国继续与上述四国就西部边界问题进行谈判。这时五国形成了“4+1”(原苏联四个共和国和中国)的新谈判机制，即联合划界和边界地区裁减军备两个委员会，这也成为“上海五国”机制以及上海合作组织的雏形。
新的中俄西部边界问题并不复杂(原争议较大的地区都成了中国与其他中亚国家的问题)，因而解决起来也比较快， 1994年9月，中俄双方在莫斯科签署了关于西段边界(约54公里)的协定，并于次年10月获得两国最高立法机关批准。至此，中俄边界98%的部分都已通过和平的方式得到法律的确认。
在苏联解体后，继承前苏联西北边界遗产的俄罗斯、哈萨克斯坦、吉尔吉斯斯坦以及塔吉克斯坦四国依然延续了同中国友好协商的势头。边界协议也水到渠成。从1994年4月的《中哈国界协定》到2002年5月中塔签署国界补充协定，原中苏西部边界的走向全部划定，中国西北边界的历史遗留问题全部解决。
在绝大部分边界划定后，中俄两国将精力集中到解决遗留的问题上来，就是额尔古纳河(俄方称为阿尔贡河)上的阿巴该图洲渚(俄方称大岛)和黑龙江(俄方称阿穆尔河)、乌苏里江(俄方称乌苏里河)交汇处的黑瞎子岛(又称抚远三角洲)地段。阿巴该图洲渚面积约62平方公里，其争议的产生主要是因为自然环境改变、河流改道。比较而言，在当代的中俄边界谈判中此处麻烦并不大。
黑瞎子岛面积约335平方公里，由于水文情况的变化，中方称为一个岛，而俄方称为两个岛(塔巴罗夫岛——也称银龙岛和大乌苏里岛)。它北临黑龙江，东南部靠乌苏里江，西南是连接黑、乌两江的抚远水道。该岛西距中国抚远县城11公里，东距俄罗斯哈巴罗夫斯克1500米。该岛地处两江汇合处，控制着黑龙江和乌苏里江航道，且紧邻俄罗斯远东重镇哈巴罗夫斯克，故成为双方谈判的一大难点。黑瞎子岛问题的产生当然是因为俄国侵吞传统中国属地。但从中国方面来说，也不是没有失误，而且应该是中国外交史上值得书上一笔的严重错误。黑瞎子岛本非沙俄控制领土，即使是中方视为不平等条约的1860年《北京条约》文本部分也清楚地标明了两国以两江(黑龙江和乌苏里江)为界，位于主航道中心线以南的黑瞎子岛当属中国领土。然而，当时代表中国签约的清政府既昏庸无知，又被英法联军搞得魂不守舍，竟然忽视了条约附图的重要性，只是由俄方代表信手在百万分之一的地图上划了一道红线。[18]1861年6月，清朝政府与沙俄代表在兴凯湖举行了两国勘界会议。是次会议上签署、交换了《北京条约》附图。在态度强硬、准备充足的俄方面前，中国代表进一步加重了自己的错误。作为会议成果签署的《北京条约补充条款》明确写到，会议主旨是签署和交换有关《北京条约》所编绘的边界地图和详细记文，且所有交换文本核对完全相符，作为《北京条约》的附件。然而，前述沙俄代表所绘地图不仅不精确，且存在严重错误，却作为条约一部分记载在文件中，为以后双方争执埋下了“祸由”。[19]

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